生殖系统可分为外生殖器和内生殖器，育的影响即阴道、生殖宫颈、系统子宫、感染输卵管和卵巢。对生阴道正常状态下含有多种微生物，育的影响但主要集中在下1／3段，生殖以乳酸杆菌为主，系统其他微生物数量极少，感染PH值维持弱酸性状态。对生如果出现阴道毛滴虫感染，育的影响阴道PH值出现偏碱性，不利于乳酸杆菌生长，因此可合并多种菌群失调的表现，此时女性可自觉外阴瘙痒，严重时可伴有尿频、尿痛，但仍有少数病人虽携带滴虫而无症状。这种阴道环境使得精子的生存受到严重的影响，并可能通过性行为传染给性伴侣，造成对方生殖系统的炎症，影响生育功能。与滴虫性阴道炎同时并存还有细菌性阴道病，后者可造成逆行的上生殖道感染，造成输卵管不通，从而导致女性不孕。另外一种常见的阴道炎症是霉菌性阴道炎，临床表现为外阴严重的痒痛不适。频繁发作的霉菌性阴道炎，可能与血糖代谢异常、糖类食物进食过多、男性的包皮过长、抗生素的使用有关，可造成精子存活率下降，动力降低，从而造成不育。长期的糖代谢异常可造成排卵障碍，同样造成不孕。
内生殖器的炎症与逆行感染有关，其中，子宫内膜炎症造成胚胎着床失败，卵巢炎症造成卵子生成障碍，输卵管炎症造成精卵无法正常结合，均会导致不孕不育。所以，要认真对待生殖道感染，切不可掉以轻心。生殖道感染的诊断非常重要，不能为了某些利益滥用药物治疗。